使用
安瓿瓶熔封机熔封的安瓿，第二天用忒斯拉线圈检验真空度，确认无针孔无裂纹。另外，把安瓿冷藏数日，然后恢复到室温再检验真空度亦可。也有人在1—2天后和10天后再次检验。有人为了堵塞由于
安瓿瓶熔封机熔封后的安瓿在冷却过程中产生的应变所导致的针孔，在熔封部分预先涂抹苉(picene)、环氧类树脂(araldite)以及固体石蜡和高真空化合物(一种防止漏气的性能较强的胶状物)的混合物(1：3)。
如果特别注意到真空的安瓿开封时从外部吸入杂菌的危险性，可在安瓿内封入干燥氮气。使用氮气时，首先，把安瓿里的空气抽掉，充满一气压的千燥氮气(通过含碱性焦性没食子酸吸收其中氧气)，再次抽气。同样的操作反复2次，充满干燥氮气熔封。但是，熔封氮气并不能期待冷冻干燥菌的保存效果比真空熔封时还要好。而且，此法还有不易判断熔封是否完整的缺点。
管形瓶的真空封塞如下：干燥完毕后，从外部用手柄进行操作，以干燥机小室内部的封塞板对橡胶塞加压二次。如果使用大型机，则靠按钮操作使干燥架上下移动，加压封塞。封塞的管形瓶，待干燥机内恢复常压后取出，用忒斯拉线圈检验真空度，套上铝帽拧紧，冷藏数日后，再次确认真空度。
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